Hanlivou nálepku „zahraniční agent“ rozdává Moskva na základě zákona schváleného v roce 2012, podle něhož se takto označuje každá nevládní organizace přijímající peníze ze zahraničí. V roce 2017 ruský parlament tento zákon novelizoval tak, že ho lze použít i proti médiím. Rusko rovněž zavedlo zákon, který umožňuje zakázat „nežádoucí“ organizace.
Ředitel FBK Ivan Ždanov na twitteru napsal, že fond žádné peníze z ciziny nedostává. „Náklady na činnost FBK hradí výlučně občané Ruské federace, žádné zahraniční financování naše organizace nemá,“ napsal Ždanov, podle něhož je krok ministerstva spravedlnosti „dalším pokusem fond umlčet“.
Organizace označené za zahraničního agenta jsou zařazovány do zvláštního seznamu ministerstva spravedlnosti. Musejí úřadům předávat čtvrtletní zprávy o zdrojích svého financování, o způsobech nakládání s finančními prostředky a o osobách, které organizaci řídí. Veškerá veřejná komunikace musí být opatřena sdělením, že jde o zahraničního agenta.
Počátkem letošního srpna hlavní ruská kriminální ústředna zahájila trestní stíhání FBK pro podezření z praní špinavých peněz. Podle kriminalistů fond svou činnost financuje penězi, které pocházejí z kriminální činnosti. Účty FBK policie obstavila.
Navalnyj založil FBK v roce 2011. Výsledkem jeho vyšetřování byly články, v nichž ze zneužití moci a osobního obohacování obvinil kromě jiných premiéra Dmitrije Medveděva, šéfa ruské Národní gardy Viktora Zolotova nebo mluvčího prezidenta Dmitrije Peskova.